Средняя продолжительность жизни бернского зенненхунда - 8 лет. Основные причины смерти: онкология (в том числе лимфомы и опухоли печени) (46%), болезни опордно-двигательного аппарата (6%), возрастные патологии (6%) и др.
Дефицит фактора I: возможно, наследуется как аутосомно-рецессивный признак, тяжелое течение в этой породе.
Дефицит фактора VII: возможно, наследуется как аутосомо-рецессивный признак.
Дисплазия локтевого сустава: несросшийся локтевой отросток (отношение шансов 5,1) и фрагментированный венечный отросток (отношение шансов 1,4); частая причина хромоты в этой породе.
Дисплазия тазобедренного сустава: предрасположены кастрированные кобели, отношение шансов 7,2 в одном исследовании.
Паностит (эностоз, эозинофильный паностит): предрасположены молодые кобели, отношение шансов 2,8.
Остеохондроз плечевого сустава: предрасположены кобели; возраст начала заболевания 4-7 месяцев, но может быть и старше; отношение шансов 47,1 (по сравнению с смешанными породами).
Гистиоцитоз (локализованнный и диссеминированный): подозревается полигенное наследование; подвержены пожилые собаки (7-8 л), чаще встречается у кобелей.
Гистиоцитоз (системный): встречается редко, возможен полигенный тип наследования, подвержены молодые собаки (3-4 г)
Опухоли потовых желез: отмечена породная предрасположенность к аденоме апокринных протоков, средний возраст 9,1 г.
Гипомиелинизация центральной нервной системы: редкое заболевание, подозревается аутосомно-рецессивный тип наследования, первые признаки отмечают в возрасте 2-8 недель.
Идиопатическая эпилепсия: возраст начала 6 мес - 6 лет, полигенный тип наследования.
Менингит и полиартрит: редкое заболевание, возраст начала до года, этиология неизвестна, предполагается, инфекция или влияние окружающей среды.
Катаракта: возможно наследственная; возраст начала 1 г, может прогрессировать и влиять на зрение; локализация: задняя подкапсулярная кора хрусталика.
Заворот века: подозревается полигенный тип наследования.
Генерализованная прогрессирующая атрофия сетчатки (ГПАС): семейное заболевание, возможно, наследственное.
Семейное заболевание почек (мембранозно-пролиферативный гломерулонефрит и интерстицинальный нефрит): подозревается аутосомно-рецессивный тип наследования; у заболевших собак в возрасте 2-5 лет отмечалась почечная недостаточность и выраженная протеинурия; у большинства исследованных собак был высокий титр антител к Borrelia burgdorferi, которая, возможно, играет роль в развитии этого заболевания.
Кистозная гиперплазия эндометрия-пиометра комплекс (пиометра): отмечена породная предрасположенность, частое заболевание пожилых сук (средний возраст 7,25 л), в большинстве случаев развивается на 12 неделю эструса.